在这部我的青春的阿卡迪亚科幻/动画片中,20世紀から約1000年後の未来、外宇宙へと進出した地球人は、謎の異星人イルミダス星人との戦いに敗れ、難民化した地球人は絶望し、イルミダス占領下の地球へ失意の帰還をしていた。
そんな屈辱の中、難民達を地球へと送り届けていた若き日のハーロックの大山トチローとエメラルダスとの運命の出会い、そしてハーロックが愛した生涯ただ一人の女性マーヤへの愛と別れを描く。ハーロック一族の先祖ファントム・F・ハーロックの記憶から辿ることから始まる。
After a drawn-out, viciously-fought war, the earth has been conquered by the alien Illumidus Empire. Harlock, a captain in earth's fleet, crashes his ship to prevent the Illumidus from using it, and flat-out refuses to join them. With the help of his allies, Tochiro and the space pirate Emereldas, and his lover Miya, he wages a private and bitter war against the Illumidus.
